ЛАБОРАТОРИИ:

• Лаборатория систематики высших растений
• Лаборатория микологии
• Лаборатория организации и цифровизации гербарного фонда
• Лаборатория геоботаники
• Лаборатория трансформации, экологии и картирования растительности
• Лаборатория этноботаники
• Лаборатория биологических ресурсов и технологии получения индивидуальных веществ
• Лаборатория биоморфологии и фитоинтродукции
• Лаборатория лесоведения
• Лаборатория дендрохронологии и защиты растений
• Лаборатория ландшафтной архитектуры и акклиматизации
• Централизованная экспериментальная лаборатория

Центр растительного разнообразия и прикладных исследований:

• Бриологическая биология
• Альгология
• Лихенология
• Растения промышленного значения
• Эндемичные, редкие и наркотические растения
• Банк семян

Региональные опытно-экспериментальные пункты:

• Каррарский региональный опытно-экспериментальный пункт
• Закатальский региональный опытно-экспериментальный пункт
• Сарайский региональный опытно- экспериментальный пункт

ОТДЕЛЫ И СЕКТОРЫ:

Отдел поддержки исследований:

• Сектор проектов и грантов
• Офис инноваций и трансфера технологий
• Офис данных и аналитики

Административный отдел:

• Сектор документооборота и связей с общественностью
• Сектор человеческих ресурсов и права
• Сектор информационных технологий

Финансовый отдел:

• Сектор финансов и бухгалтерии
• Сектор технического обеспечения 

Сектор стратегического развития, мониторинга и оценки

Сектор библиотеки и электронных ресурсов

Сектор подготовки научных кадров

Сектор международного сотрудничества

Сектор закупок и снабжения