Отдел систематики и биоразнообразия

• Лаборатория систематики и географии высших растений
• Лаборатория альгологии и лихенобриологии

Отдел гербарий

Лаборатория микологии

Лаборатория фитосоциологии экосистем

• Банк семян

Отдел растительных ресурсов

Лаборатория этноботаники

Отдел экспериментальной ботаники 

• Лаборатория экологической физиологии растений
• Лаборатория биофизики клетки

Лаборатория взаимосвязи растение-почва

Отдел образования

• Ботанический музей

Отдел научной информации и инноваций

Отдел по связям с общественностью